目前电子商务的安全问题比较严重，最突出的表现在计算机网络安全和商业诚信问题上。因为篇幅问题，本文只侧重于计算机网络安全问题的描述和解决对于其他方面的问题不作详细的分析。与以往相比电子商务安全呈现出以下特点：

(一)木马病毒爆炸性增长，变种数量的快速增加

据统计，仅2009年上半年挂载木马网页数量累计达2.9亿个，共有11.2亿人次网民访问挂载木马，2010年元旦三天就新增电脑病毒50万。病毒的数量不仅增速变快，智能型，病毒变种更新速度快是本年度病毒的又一个特征。总体而言，目前的新木马不多，更多的是它的变种，因为目前反病毒软件的升级速度越来越快，病毒存活时间越来越短，因此，今天的病毒投放者不再投放单一的病毒，而是通过病毒下载器来进行病毒投放，可以自动从指定的网址上下载新病毒，并进行自动更新，永远也无法斩尽杀绝所有的病毒。同时病毒制造、传播者利用病毒木马技术进行网络盗窃、诈骗活动，通过网络贩卖病毒、木马，教授病毒编制技术和网络攻击技术等形式的网络犯罪活动明显增多，电子商务网络犯罪也逐渐开始呈公开化、大众化的趋势。

(二)网络病毒传播方式的变化

过去，传播病毒通过网络进行。目前，通过移动存储介质传播的案例显着增加，存储介质已经成为电子商务网络病毒感染率上升的主要原因。由于U盘和移动存储介质广泛使用，病毒、木马通过autorun.inf文件自动调用执行U盘中的病毒、木马等程序，然后感染用户的计算机系统，进而感染其他U盘。与往年相比，今年通过网络浏览或下载该病毒的比例在下降。不过，从网络监测和用户寻求帮助的情况来看，大量的网络犯罪通过“挂马”方式来实现。“挂马”是指在网页中嵌入恶意代码，当存在安全漏洞的用户访问这些网页时，木马会侵入用户系统，然后盗取用户敏感信息或者进行攻击、破坏。通过浏览网页方式进行攻击的方法具有较强的隐蔽性，用户更难于发现，潜在的危害性也更大。

(三)网络病毒给电子商务造成的损失继续增加

调查显示，浏览器配置被修改，损坏或丢失数据，系统的使用受限，网络无法使用，密码被盗造成都给电子商务造成严重的破坏后果。2006年“熊猫烧香”病毒利用蠕虫病毒的传播能力和多种传播渠道帮助木马传播，攫取非法经济利益，给被感染的用户带来重大损失。继“熊猫烧香”之后，复合型病毒大量出现，如：仇英、艾妮等病毒。同时，网上贩卖病毒、木马和僵尸网络的活动不断增多，利用病毒、木马技术传播垃圾邮件和进行网络攻击、破坏的事件呈上升趋势。